Σκοποί της «Αμάλθειας» είναι:

* Η προστασία, διάσωση και ανάδειξη όλων των ελληνικών αυτοχθόνων φυλών κατοικιδίων ζώων.
* Η βελτίωση των συνθηκών εκτροφής και αναπαραγωγής των φυλών αυτών.
* Η επανένταξη των φυλών αυτών στις κοινωνικές  δραστηριότητες των τοπικών κοινωνιών στις οποίες διαβιούν.
* Η ενθάρρυνση, καθοδήγηση και επιμόρφωση των ιδιοκτητών, θαυμαστών, φίλων, μελετητών και εκτροφέων των φυλών αυτών.
* Η καταγραφή και διατήρηση των ιδιαίτερων χαρακτηριστικών κάθε φυλής.
* Η στήριξη και βελτίωση της ελληνικής βιολογικής κτηνοτροφίας.
* Η ανάπτυξη της επικοινωνίας και η σύσφιξη των δεσμών μεταξύ των  σωματείων ή άλλων νομικών προσώπων που έχουν τους ίδιους ή παρόμοιους στόχους με αυτήν.
* Η παρακίνηση των αρμοδίων αρχών να υποστηρίξουν με κάθε πρόσφορο τρόπο την ανάδειξη και διατήρηση των φυλών αυτών.